全人類被神奇的現象一瞬間石化后過了幾千年——擁有超人般頭腦、天生的科學少年·千空蘇醒了　　在文明遭到毀滅的石頭世界里千空集結新伙伴的力量一起建立“科學王國”最終目標是用科學的力量復原整個世界但是由靈長類最強的高中生獅子王司領導的“武裝帝國”卻步步為營旨在凈化人類的司試圖通過使用強大的力量來阻止科學的發展　　科學 vs 武力的戰斗經過激戰千空等人的科學王國占優勢之后兩國終于和解　　由于同伴的謀反而處于冷休眠狀態的司為了復活全人類科學王國以石化光線的發生源、地球的背面·新世界作為目標　　沖出世界解開石化之謎石頭世界大航海時代終于開幕——?