悲傷的愛德華和阿爾馮斯兩兄弟試圖利用煉金術中最大的禁忌——人體煉成術救活撒手人寰的母親誰知卻遭遇巨大的災難失去身體的阿爾馮斯其靈魂被封禁在鎧甲中愛德華則以自己的右臂和左腳為代價迫使弟弟止步冥國門前許多年后愛德華（山田涼介 飾）成長為這個國家中最年輕的鋼之煉金術師他與弟弟（水石亞飛夢 配音）上下一心共同奔跑在尋找賢者之石的道路上與此同時神秘的人造人拉絲特（松雪泰子 飾）、恩維（本鄉奏多 飾）盤桓這個國家的角落她們策劃者恐怖的勾當一時間上空陰云密布…… 　　本片根據荒川弘的原作漫畫改編