近未來の東京車は列なり、電車が走り、ひっきりなしに人々が行き交う、何気ない日常の光景が繰り広げられている街の上空に突如現れる黒い點その點は見る見る大きさを増していき、街を飲み込んでいく車も、電車も、そして人々も――東京は直徑數十キロもの黒いドーム、ブラックポイントに覆われた拡大を止めたブラックポイントの間近ギリギリ飲み込まれるのを免れたスカイツリーが屹立している異様な光景を前に呆然としている人々――と、ブラックポイント中から何かが近づいてくるいつ果てるとも知れない絶望の中で、人々はブラックポイントより來たりし者を『Zillions of enemy X』、ゼクスと呼んだ―