二十世紀最后的夏天那一天人類終于知道自己并非地球這顆行星唯一的統治者　　巨型生物「怪獸」以及驅逐怪獸的終極存在「哥斯拉」出現了經歷與怪獸之間長達半個世紀的戰爭人類屢戰屢敗最終計劃逃出地球2048年經過中央政府管理的人工智能篩選一部分人類乘坐跨恒星移民飛船「阿拉特拉姆」號踏上了前往11.9光年之外的「鯨魚座τ星e」的旅程然而人類花費20年所抵達的星球與地球之間的環境差距遠超預期不適宜人類生存　　移民飛船上有一名青年——晴雄4歲的時候他親眼目睹父母被哥斯拉殺害20年來他始終想著回到地球消滅哥斯拉移民的可能性已經灰飛煙滅飛船內的生存環境也越發惡劣以晴雄為中心的「重返地球派」成為主流他們決定經過危險的長距離亞空間航行返回地球　　然而地球經過2萬年的演化已經形成了以哥斯拉為頂端的生態體系完全成為了一個未知世界　　最終人類能否奪回地球晴雄的命運又將如何