擁有一頭青色頭發(fā)的男主角名字將叫作深井 青(フカイ·アオ這名字在日語(yǔ)中帶有“深青”的意義）是一名13歲少年青的父親蘭頓·薩斯頓(Renton Thurston、レントン·サーストン)行蹤不明而母親優(yōu)萊卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美軍帶走了由于繼承了母親的特殊基因使得他能夠看見(jiàn)人眼所不能看到的東西如粒徑為20nm大小的光粒子紅外線、紫外線等等（但在外太空這一特殊生理受到限制）小時(shí)與診療所里的老醫(yī)生深井 敏夫一同生活現(xiàn)正在Generation Blue（藍(lán)色世代）中　　女主角的名字將是阿拉塔·娜露同樣是13歲是與青一同成長(zhǎng)的青梅竹馬娜露因?yàn)橥陼r(shí)的事故而使擁有”ユタ”的力量(猶達(dá)是日本沖繩以占卜為職業(yè)的靈媒師的名稱(chēng))的眼睛醒覺(jué)娜露有能夠聽(tīng)懂珊瑚巖心聲的特異功能這是因?yàn)樯汉鲙r的一部分在她體內(nèi)成長(zhǎng)從某種程度上來(lái)說(shuō)她和珊瑚巖存在部分融合但正是因?yàn)檫@樣導(dǎo)致她自小身體虛弱需要把氧氣放入在手上的吸氧器現(xiàn)與父親、妹妹及祖母一同生活中　　本作的舞臺(tái)也設(shè)定在沖繩的磐戶(hù)島上當(dāng)時(shí)的磐戶(hù)島正進(jìn)行著自治權(quán)回復(fù)運(yùn)動(dòng)但在某一天在島上出現(xiàn)的珊瑚巖受到了宿敵白細(xì)胞G-Monster的攻擊而為了保護(hù)磐戶(hù)島男主角青與人型IFO（Intelligent Flying Object）相遇并與G-Monster戰(zhàn)斗的故事就此展開(kāi)